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| Registros recuperados: 87 | |
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| Ma,Zhihui; Wang,Yuquan; Wei,Wenhui; Ru,Zhengang. |
| ABSTRACT: In this study, a non-destructive, high-throughput, endosperm-based DNA extraction method was developed. To verify the non-destructive nature of this method, a germination test was performed on 288 seeds after sampling their endosperm, which gave a seedling emergence rate that was higher (97.6%) than that of the control group (92%). To confirm the feasibility of the new method, DNA was extracted from plants of a BC1F2 population by two different methods, namely, from endosperm using our rapid, high-throughput method (ER-DNA) and from young leaves emerging from the same sampled seed using the CTAB method (LC-DNA). The ER-DNA was undetectable by agarose gel electrophoresis, but was found to be an adequate replacement for LC-DNA for the... |
| Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Wheat; Triticum aestivum; SSR; Segregation population. |
| Ano: 2019 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782019000900200 |
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| Contreras Toledo, Aremi Rebeca. |
| A partir de la domesticación de chile (Capsicum annuum L.) en México, se ha generado una gran diversidad dentro de esta especie en nuestro país, derivada de la selección de los agricultores para diferentes usos, siendo el chile Poblano uno de los más importantes y el más representativo del Estado de Puebla; sin embargo, el rendimiento de chile poblano en esta región ha presentado una reducción en los últimos años, debido, en parte, a la falta de semilla mejorada que debe ser seleccionada con base en las necesidades de los propios productores, existiendo la potencial pérdida de este germoplasma. Los objetivos de este estudio fueron estimar la diversidad genética y determinar sus posibles patrones de distribución, diferenciar grupos genéticos de variedades y... |
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Palavras-chave: Capsicum annuum; SSR; Polimorfismo; Diferenciación genética; Polymorphism; Genetic differentiation; Maestría; Genética. |
| Ano: 2011 |
URL: http://hdl.handle.net/10521/400 |
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| Contreras Toledo, Aremi Rebeca. |
| A partir de la domesticación de chile (Capsicum annuum L.) en México, se ha generado una gran diversidad dentro de esta especie en nuestro país, derivada de la selección de los agricultores para diferentes usos, siendo el chile Poblano uno de los más importantes y el más representativo del Estado de Puebla; sin embargo, el rendimiento de chile poblano en esta región ha presentado una reducción en los últimos años, debido, en parte, a la falta de semilla mejorada que debe ser seleccionada con base en las necesidades de los propios productores, existiendo la potencial pérdida de este germoplasma. Los objetivos de este estudio fueron estimar la diversidad genética y determinar sus posibles patrones de distribución, diferenciar grupos genéticos de variedades y... |
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Palavras-chave: Capsicum annuum; SSR; Polimorfismo; Diferenciación genética; Polymorphism; Genetic differentiation; Maestría; Genética. |
| Ano: 2011 |
URL: http://hdl.handle.net/10521/400 |
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| Ghneim Herrera,Thaura; Posso Duque,Duina; Pérez Almeida,Iris; Torrealba Núñez,Gelis; Pieters,Alejandro J; Martinez,César P; Tohme,Joe M. |
| In Venezuela, pedigree analyses indicate that the rice varieties currently under cultivation are closely related. Effective breeding programs, based on knowledge of the genetic diversity of cultivars, are needed to broaden the genetic bases of rice germplasm in the country. In this study, we used a set of 48 simple-sequence-repeat (SSR) markers to assess the genetic diversity of 11 Venezuelan rice cultivars, released by the National Rice Breeding Program between 1978 and 2007. A total of 203 alleles were detected, the number of alleles (NA) per marker ranged from 2 to 9, with an average of 4.23. The average genic diversity (H) over all SSR loci for the 18 genotypes was 0.524, ranging from 0.105 to 0.815. Positive correlations were found between H at each... |
| Tipo: Journal article |
Palavras-chave: DNA fingerprinting; Genetic diversity; Rice; SSR. |
| Ano: 2008 |
URL: http://www.scielo.cl/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0717-34582008000500003 |
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| Paterniani,Maria Elisa Ayres Guidetti Zagatto; Guimarães,Paula de Souza; Lüders,Reginaldo Roberto; Gallo,Paulo Boller; Souza,Anete Pereira de; Laborda,Prianda Rios; Oliveira,Karine Miranda. |
| Objetivou-se avaliar o desempenho de híbridos simples de milho (Zea mays L.), obtidos de cruzamentos dialélicos entre linhagens divergentes, estimar a capacidade de combinação das linhagens e verificar se a divergência genética entre as linhagens, obtida por marcadores moleculares, é correlacionada com a heterose dos híbridos simples no campo. Trinta e seis híbridos resultantes de um dialelo parcial foram avaliados em Campinas e em Mococa e as 12 linhagens parentais somente em Campinas, a fim de se calcular a heterose dos híbridos. O delineamento experimental empregado foi o de blocos ao acaso, com três repetições e 2 testemunhas comerciais. Avaliaram-se os caracteres: altura da planta (AP), altura da espiga (AE) e massa de grãos (MG). Análises de... |
| Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Zea mays; Dialelo parcial; Produtividade; AFLP; SSR. |
| Ano: 2008 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0006-87052008000300012 |
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| PIRES,MARCELA VERSIANI VENÂNCIO; FALEIRO,FÁBIO GELAPE; SILVA,JOSÉ CARLOS SOUSA; MELO,JOSÉ TEODORO DE; PEIXOTO,JOSÉ RICARDO. |
| RESUMONeste trabalho, objetivou-se avaliar a variabilidade genética da coleção de trabalho de acessos de araticum da Embrapa Cerrados e outros materiais próximos ao Distrito Federal, utilizando marcadores moleculares RAPD, microssatélites e análise de características morfológicas. Folhas de 18 acessos de araticum foram coletadas e utilizadas para a extração das amostras de DNA genômico, as quais foram amplificadas para obtenção de marcadores moleculares RAPD e microssatélites. Na análise morfológica, foram avaliadas 23 características dos acessos de araticum. As dissimilaridades genéticas entre os 18 genótipos de araticum evidenciaram a variabilidade genética dos acessos e as análises de agrupamento levaram à formação de três grupos de similaridade.... |
| Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Marcadores moleculares; SSR; Caracterização; Recursos genéticos. |
| Ano: 2015 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-29452015000100149 |
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| Martins,Antonio Baldo Geraldo; Rodrigues,Maria Gabriela Fontanetti; Paula,Deise Reis de; Mendes,Hélio Sandoval Junqueira; Arantes,Flávio Cese; Silva,Cristina Lacerda Soares Petrarolha. |
| Pertencente à família Lauraceae, o abacateiro compreende três raças hortícolas: antilhana, guatemalense e mexicana. Os marcadores moleculares são uma ferramenta rápida e eficaz para estudos genômicos, uma vez que detectam o polimorfismo diretamente ao nível do DNA e não sofrem qualquer tipo de influência ambiental. Com base nesse polimorfismo, é possível fazer inferências sobre as relações entre o genótipo e o fenótipo dos indivíduos, o que, em última análise, permite aumentar a eficiência dos programas de melhoramento. Diante o exposto, o objetivo foi investigar a diversidade genética entre sete variedades de abacate a partir de 5 lócus de marcadores moleculares microssatélites (SSR). Nas amostras de abacateiros avaliadas, encontrou-se um total de 18... |
| Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Persea americana; SSR; Fingerprinting; Banco de germoplasma. |
| Ano: 2011 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-29452011000400016 |
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| Arias,Renée S; Stetina,Salliana R; Scheffler,Brian E. |
| Currently, a large number of microsatellites are available for Rotylenchulus reniformis (reniform nematode); however, two barriers exist for genotyping samples from different geographical areas. The limited amount of nucleic acids obtained from single nematodes which would require their multiplication to obtain enough DNA for testing; and the strictly regulated transport of live samples and multiplication in greenhouse for being a plant pathogen. Whole-genome amplification (WGA) of samples consisting of one and five dead gravid females with their associated egg masses was successfully performed on disrupted tissue using three commercial kits. DNA yield after WGA ranged from 0.5 to 8 µg and was used to test 96 microsatellite markers we previously developed... |
| Tipo: Journal article |
Palavras-chave: Genotyping; Reniform nematode; SSR; STR; WGA. |
| Ano: 2011 |
URL: http://www.scielo.cl/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0717-34582011000300014 |
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| Guimarães,Paula de Souza; Paterniani,Maria Elisa Ayres Guidetti Zagatto; Lüders,Reginaldo Roberto; Souza,Anete Pereira de; Laborda,Prianda Rios; Oliveira,Karine Miranda. |
| O objetivo deste trabalho foi avaliar a produtividade de híbridos simples de milho obtidos de cruzamentos dialélicos entre linhagens divergentes, estimar a capacidade de combinação das linhagens e confirmar se a divergência genética entre as linhagens, obtida por marcadores moleculares, é correlacionada com a heterose dos híbridos simples no campo. Trinta e seis híbridos resultantes do dialelo parcial e as 12 linhagens parentais foram avaliadas em Campinas em blocos ao acaso, com três repetições e duas testemunhas. A capacidade de combinação das linhagens foi estimada de acordo com o modelo 4 de Griffing. Estimaram-se a correlação matricial, mediante a estatística de Mantel, entre heterose, produtividade e capacidade específica de combinação com... |
| Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Zea mays; Marcadores moleculares; Dialelo parcial; Capacidade de combinação; AFLP; SSR. |
| Ano: 2007 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2007000600007 |
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| Miranda,Kássia Marques Corrêa; Guimarães,Rejane Araújo; Silva,Marcos José da; Oliveira,Patrícia Rasteiro Ordiale; Ribeiro,Thania Gonçalves; Mendes,Thainara Policarpo; Telles,Mariana Pires de Campos; Soares,Thannya Nascimento. |
| ABSTRACT The genus Manihot Mill. contains about 120 species of which about 104 occur in Brazil. We tested the cross-amplification of ten microsatellite markers developed for Manihot esculenta in 15 species of Manihot endemic to the Brazilian Cerrado. We also evaluated the genetic diversity of Manihot irwinii, M. orbicularis, and M. purpureocostata. Ten pairs of primers were amplified among 14 species of Manihot. The percentage of polymorphic loci per species varied from 70 to 100 %. Nine markers showed amplification and polymorphism when evaluated on polyacrylamide gel. The markers were combined to form three sets for multiplex genotyping for genetic diversity analysis, and showed 51, 75, and 75 alleles in M. irwinii, M. orbicularis, and M.... |
| Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Genetic diversity; Polymorphism; SSR; Transferability wild cassava. |
| Ano: 2020 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0102-33062020000400772 |
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| Oliveira,Gilmara Alvarenga Fachardo; Pádua,Juliano Gomes; Costa,Juliana Leles; Jesus,Onildo Nunes de; Carvalho,Fabiana Moraes de; Oliveira,Eder Jorge de. |
| The aim of this study was to evaluate the selected 41 SSR markers developed for yellow passion fruit (Passiflora edulis f. flavicarpa Sims.) for their transferability to 11 different Passiflora species. Twenty-one SSR were successfully amplified in 10 wild species of passion fruit producing 101 bands. All the markers were amplifiable for at least one species. The mean transferability was 68,8%, ranging from 15,4% (primer PE11) to 100 % (PE13, PE18, PE37, PE41 and PE88). Transferability was higher for the species from the Passiflora subgenus than for those from the Decaloba and Dysosmia subgenus. The results indicated a high level of nucleotide sequence conservation of the primer regions in the species evaluated, and consequently, they could potentially be... |
| Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Transferability; SSR; Passion fruit. |
| Ano: 2013 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-89132013000500009 |
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| Apolinário-Silva,Caroline; Ferreira,Dhiego G.; Cavenagh,Analiza F.; Aprígio,Nícollas G. O.; Galindo,Bruno A.; Carlsson,Jens; Sofia,Silvia H.. |
| ABSTRACT Data on 15 novel microsatellite loci from the Neotropical fish Bryconamericus aff. iheringii are presented here. Analyses of 32 individuals from four different streams revealed 192 different alleles, ranging from four to 32 alleles per locus (mean of 12.8 per locus). Observed and expected heterozygosities ranged from 0.094 to 0.813 and 0.205 to 0.952, respectively. These loci showed high polymorphic information content and will be a resource for genetic studies of B. aff. iheringii. Furthermore, several loci also amplified other small Neotropical Characidae (Piabarchus stramineus and Piabina argentea) and should be useful for these species. |
| Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Genetic diversity; Lambarizinho; Molecular markers; Neotropical fish; SSR. |
| Ano: 2018 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1679-62252018000100218 |
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